Здравствуйте, Анна!

На сколько я поняла, объект IV Категории был поставлен на госучет до принятия новых Критериев отнесения объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, к объектам I, II, III и IV категорий, утв. Постановлением Правительства РФ от 31.12.2020 N 2398, поэтому присвоение IV Категории совсем не означает, что выбросов у Вас нет, тем более, что какую-то сумму платы за них Вы насчитали, если авансы при этой сумме у Вас выходят копеечные, то значит так и есть, вносите копейки, тут уж платить в любом случае придётся, раз выбросы есть.

Если опустить спорный вопрос должны ли Вы вообще вносить плату за объект IV Категории, т.к. получается Вы уже на него для себя ответили, то при расчете платы исходите из первичного учета выбросов (согласно ст. 30 Федерального закона от 04.05.1999 N 96-ФЗ "Об охране атмосферного воздуха"), основываясь на инвентаризации, Постановление Правительства РФ от 03.03.2017 N 255 "Об исчислении и взимании платы за негативное воздействие на окружающую среду" (ред. от 17.08.2020) не содержит порядка исчисления платы для объектов IV Категории, поэтому природопользователи вынуждены проявлять творческий подход.

Разрабатывать программу ПЭК и подавать отчет по данному объекту Вам точно не нужно.